生物信息學(xué)分析實(shí)驗(yàn)檢測(cè)
生物信息學(xué)(Bioinformatics)是研究生物信息的采集、處理、存儲(chǔ)、傳播,分析和解釋等各方面的學(xué)科,也是隨著生命科學(xué)和計(jì)算機(jī)科學(xué)的迅猛發(fā)展,生命科學(xué)和計(jì)算機(jī)科學(xué)相結(jié)合形成的一門(mén)新學(xué)科。它通過(guò)綜合利用生物學(xué),計(jì)算機(jī)科學(xué)和信息技術(shù)而揭示大量而復(fù)雜的生物數(shù)據(jù)所賦有的生物學(xué)奧秘。
生物信息學(xué)分析實(shí)驗(yàn)檢測(cè)服務(wù)流程
1、客戶(hù)提供研究方向
2、生信工程師提供分析提綱
3、反饋溝通
4、進(jìn)行數(shù)據(jù)分析
5、出具分析報(bào)告
三、研究案例展示(芯片分析)
研究背景:
肝癌可以分為三種類(lèi)型:肝細(xì)胞癌、膽管細(xì)胞性肝癌和混合性肝癌。本研究的目的是為了尋找這三種肝癌基因表達(dá)情況的不同點(diǎn)和相同點(diǎn)。
研究策略:
1、從NCBI GEO數(shù)據(jù)庫(kù)中下載轉(zhuǎn)錄表達(dá)譜,包括70張肝細(xì)胞癌芯片,13張膽管細(xì)胞性肝癌芯片和7張混合性肝癌芯片。
2、對(duì)三種類(lèi)型的肝癌進(jìn)行兩兩比較,尋找差異基因。
3、蛋白互作網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建,聚類(lèi)分析,MCODE分析,GSEA富集分析。