Fragment AnalyzerTM全自動(dòng)毛細(xì)管電泳系統(tǒng)是基于熒光檢測技術(shù)和毛細(xì)管電泳技術(shù)發(fā)展而來的新型DNA/RNA片段分離儀器,它采用敏感的嵌入染料以及強(qiáng)大的LED光源,避免了傳統(tǒng)方法中對熒光標(biāo)記引物的依賴。
DNA/RNA片段的分離是通過對毛細(xì)管列陣?yán)锾畛涞目蓪?dǎo)電的分離膠施加高壓電場,依據(jù)核酸片段長度不同在凝膠電泳中遷移速度不同的原理,來達(dá)到分離檢測的目的。
TILLING(Targeting Induced Local Lesions In Genomes),即定向誘導(dǎo)基因組局部突變技術(shù),是一種高通量、低成本且全新的反向遺傳學(xué)研究方法。TILLING技術(shù)借助高通量的檢測手段,可快速有 效從化學(xué)誘變劑處理的突變?nèi)后w中進(jìn)行點(diǎn)突變鑒定、突變體鑒定和突變表型鑒定以及SNP檢測等。傳統(tǒng)的未知突變檢測是一個(gè)挑戰(zhàn)且費(fèi)時(shí)費(fèi)力的過程。由美國 AATI公司研發(fā)改進(jìn)的TILLING流程省去熒光標(biāo)記引物的使用和樣品的清洗環(huán)節(jié),大大縮短檢測時(shí)間和人工操作步驟,使得突變檢測更加快速、更加容易。
目前,F(xiàn)ragment AnalyzerTM全自動(dòng)突變檢測系統(tǒng)已成功應(yīng)用于水稻、玉米、小麥、萵苣、西紅柿、大豆的反向遺傳學(xué)TILLING研究中。
2.Fragment AnalyzerTM系統(tǒng)Tilling分析優(yōu)勢
● 全自動(dòng) 分離膠和樣品自動(dòng)上樣,無需手動(dòng)灌膠,避免交叉污染
● 高通量 可一次檢測12或96個(gè)樣品,最多為288個(gè)樣品
● 高分辨 分辨率為2bp
● 高靈敏 檢測濃度可達(dá)5pg/ul
● 運(yùn)行快 15min內(nèi)完成700bp片段分離
● 成本低 無需芯片,毛細(xì)管可反復(fù)利用
● 易操作 PROSize2.0軟件直觀顯示分析結(jié)果
● 用途廣 可分析片段范圍為35-40000bp
● 更靈活 可提供12和96兩種型號的毛細(xì)管列陣
3.Fragment AnalyzerTM在TILLING平臺(tái)的應(yīng)用
- 點(diǎn)突變鑒定;突變體鑒定;突變表型鑒定;突變特性研究
- SNP檢測和發(fā)掘;
- 自然資源評價(jià);
- 作物品種改良;
- 創(chuàng)造突變資源;
- 功能基因組學(xué)研究
4.與傳統(tǒng)DNA突變檢測技術(shù)相比,F(xiàn)ragment AnalyzerTM優(yōu)勢
1)不需要標(biāo)記的引物
2)省去脫鹽清除步驟
3)分析片段長度可達(dá)2kbp以上,可達(dá)40k
4)可同時(shí)分析8個(gè)不同的DNA樣本組成的DNA池
5)電泳時(shí)間短
6)PRO Size™ 軟件全自動(dòng)突變檢測