通過環(huán)境工程的手段,利用微生物的新陳代謝作用和物理化學(xué)作用，完成對糞尿污染物的降解，zui終轉(zhuǎn)化為CO2 和水排入環(huán)境，同時再生出清潔的水供沖洗廁所使用或直接排放進入環(huán)境。

生態(tài)廁所通過營造以特殊馴化的高效復(fù)合微生物為主的微生物生態(tài)系統(tǒng)，對糞便進行生態(tài)處理凈化。首先，微生物菌種釋放出具有降解有機會功能的高蛋白酶，將大分子有機物降解為糖、脂肪酸和氨基酸等小分子有機物，微生物菌種以此為養(yǎng)分代謝出水、氣體和生物熱能，而其自身也以幾何級數(shù)繁殖。由此將糞尿中可生物降解的有機會*氧化為簡單的無機物——H2O、CO2、NO3、SO4-2、PO4-3等；水分及其它氣體直接蒸發(fā)排出，分解后極少量余渣富含有機物質(zhì)、N、P、K和微量元素，可回收為高效有機肥料。同時，包含著大量好氧微生物的高效生物活性填料可將糞尿中的臭氣吸收轉(zhuǎn)化，實現(xiàn)了對糞便的分解、脫臭、凈化一體化處理。而糞尿中的大腸桿菌、寄生蟲卵等有害病菌及雜菌在60攝氏度以上高溫條件下被殺死或被微生物群落所吞噬，從而實現(xiàn)安全衛(wèi)生無害化。