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質(zhì)譜在糖蛋白研究中的應(yīng)用
糖蛋白是蛋白質(zhì)中的氨基酸側(cè)鏈被糖基化修飾后的蛋白質(zhì),廣泛存在于生物體中,具有特殊的生物學(xué)功能。研究糖蛋白的傳統(tǒng)方法一般是將糖鏈切掉并分離純化后再分別進(jìn)行研究。采用基質(zhì)輔助激光解吸/電離飛行時間質(zhì)譜(MALDI-TOF-MS)——這一軟電離生物質(zhì)譜技術(shù),可直接測定糖蛋白的平均分子量及糖含量,應(yīng)用蛋白酶切及內(nèi)切糖苷酶酶切相結(jié)合的方法,可確定糖基化位點(diǎn)及糖苷鍵類型。
一、糖蛋白平均分子量及糖含量的測定:
在糖蛋白MALDI-TOF-MS質(zhì)譜圖上表現(xiàn)為一簇峰,各峰之間約相差一個或幾個糖基,同時還出現(xiàn)多電荷峰,有些樣品中還含少量不帶糖鏈的蛋白峰。糖蛋白的分子量為這些多重峰的平均值。
從不含糖鏈的蛋白的分子量可以直接得到糖含量,但因其豐度太小難以準(zhǔn)確測定。采用內(nèi)切糖苷酶F將糖鏈切除,得到含一個GlcNAc的肽鏈,肽鏈與糖蛋白平均分子量之間的差值即為糖鏈的分子量,糖鏈的分子量與糖蛋白平均分子量的比值即為糖含量。
二、糖苷鍵類型及糖基化位點(diǎn)的測定:
糖基化位點(diǎn)的確定,則必須依賴一系列酶切反應(yīng)的實(shí)現(xiàn)來加以證實(shí)。一般步驟是:①先將糖蛋白還原烷基化、脫鹽,加Glu-c酶切,產(chǎn)物再用內(nèi)切糖苷酶酶切,含糖肽段峰將出現(xiàn)位移。采用差位酶切法對其進(jìn)行驗(yàn)證:內(nèi)切糖苷酶F(Endoglycosidase-F)切斷N-糖鏈中五糖核心區(qū)中,兩個N-已酰氨基葡萄糖間的內(nèi)糖苷鍵,而糖N肽酶F(PNGase-F)切斷糖鏈與天冬酰氨間的糖肽鍵,兩者相差一個N-已酰氨基葡萄糖(194Da);②凝集素對糖肽的提取:凝集素是一類糖結(jié)合蛋白,能專一地識別某一特定結(jié)構(gòu)的單糖或寡糖中特定的糖基序列并與之結(jié)合。核糖核酸酶B中的糖鏈為高甘露糖型,我們選用其特異性吸附凝集素----伴刀豆球蛋白(ConA)對含糖肽段進(jìn)行提取,并直接進(jìn)行MALDI-TOF-MS檢測,為今后糖肽序列分析及糖鏈結(jié)構(gòu)分析奠定了基質(zhì)譜在糖蛋白研究中的應(yīng)用糖蛋白是蛋白質(zhì)中的氨基酸側(cè)鏈被糖基化修飾后的蛋白質(zhì),廣泛存在于生物體中,具有特殊的生物學(xué)功能
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