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植物基因組的開關(guān)圖

閱讀:268發(fā)布時(shí)間:2013-7-3

為什么有些植物對(duì)溫度下降非常敏感,有些植物卻能夠耐受北方的嚴(yán)寒?原因就蘊(yùn)藏在植物的基因組中,抗性植物能夠在正確的時(shí)機(jī)激活抗性基因,從而在不利的環(huán)境條件下茂盛生長(zhǎng)。不過,人們對(duì)激活植物基因的調(diào)控機(jī)制,還并不十分了解。

McGill大學(xué)和多倫多大學(xué)的科學(xué)家們,對(duì)十字花科植物進(jìn)行了基因組研究,獲得了超過90,000個(gè)非編碼保守序列的基因組圖譜。這項(xiàng)研究于六月三十日發(fā)表在Nature Genetics雜志上,將有助于人們進(jìn)一步解析植物的基因調(diào)控系統(tǒng)。

“保守的非編碼區(qū)域,對(duì)于調(diào)控基因的開關(guān)可能有重要作用。在此基礎(chǔ)上,這些區(qū)域可以調(diào)節(jié)植物的發(fā)育,影響植物對(duì)環(huán)境條件的應(yīng)答,”這項(xiàng)研究的之一,McGill大學(xué)的Mathieu Blanchette教授說(shuō)。

十字花科是一個(gè)大型的植物家族,包括多種重要的農(nóng)作物。研究人員對(duì)一些十字花科植物進(jìn)行了基因組測(cè)序,深入分析這類植物的基因組序列。他們?cè)诨蚪M中鑒定了超過90,000個(gè)基因組區(qū)域,這些區(qū)域沒有編碼蛋白質(zhì),但在不同種屬之間高度保守。這項(xiàng)研究是對(duì)植物的非編碼保守序列作圖,可以幫助人們定位農(nóng)作物基因組中的調(diào)節(jié)區(qū)域,特別是一種主要的農(nóng)作物——油菜。

一個(gè)生物的基因組中,到底有多少具有重要功能,又有多少屬于“垃圾”DNA?這個(gè)問題一直是生物學(xué)領(lǐng)域的熱點(diǎn)話題。鑒定基因組中的蛋白編碼部分相對(duì)簡(jiǎn)單,但許多非編碼區(qū)域也具有重要的調(diào)控作用,這些區(qū)域負(fù)責(zé)在正確的條件下、正確的組織中激活特定基因。

在植物的基因組中,編碼蛋白的基因數(shù)與人類差不多。不過這項(xiàng)研究顯示,控制植物基因的調(diào)控序列要比人類的調(diào)控序列簡(jiǎn)單得多,植物調(diào)控序列的復(fù)雜性介于真菌和線蟲之間。“我們可以看到,不同生物的復(fù)雜性,并不是主要取決于基因。這種復(fù)雜性更大程度上來(lái)源于基因的調(diào)控系統(tǒng),”文章的共同作者,McGill大學(xué)的Thomas Bureau教授說(shuō)。

農(nóng)作物的一些性狀對(duì)于農(nóng)民來(lái)說(shuō)非常重要,例如抗旱、耐寒等等。目前研究人員正在進(jìn)一步解析植物的非編碼保守序列,希望鑒定與上述性狀有關(guān)的調(diào)控區(qū)域。


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