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western blot中膜的選擇是實(shí)驗(yàn)成功的關(guān)鍵點(diǎn),Western blot實(shí)驗(yàn)中一般可以選擇硝酸纖維素膜(NC) 和PVDF膜,那NC膜和PVDF膜有什么區(qū)別呢?怎樣才能選擇zui恰當(dāng)?shù)碾s交膜進(jìn)行Western blot實(shí)驗(yàn)?zāi)兀?/p>
NC膜 PVDF膜 尼龍膜的特點(diǎn)
解答:尼龍膜是較理想的核酸固相支持物,有多種類型;硝酸纖維素膜(NC膜)是目前應(yīng)用zui廣的一種固相支持物,價格*;PVDF膜介于二者之間。
就結(jié)合能力而言:尼龍膜結(jié)合DNA和RNA能力可達(dá)480-600μg/cm2,可結(jié)合短至10bp的核酸片段;硝酸纖維素膜(NC膜)結(jié)合DNA和RNA能力可達(dá)80-100μg/cm2,對于200bp的核酸片段結(jié)合能力不強(qiáng);PVDF膜結(jié)合DNA和RNA能力可達(dá)125-300μg/cm2。
就溫度適應(yīng)性而言:尼龍膜經(jīng)烘烤或紫外線照射后,核酸中的部分嘧啶堿基可與膜上的正電荷結(jié)合;硝酸纖維素膜(NC膜)依靠疏水性相互作用結(jié)合DNA,結(jié)合不牢固;PVDF膜結(jié)合牢固,耐高溫,特別適合于蛋白印跡。
就韌性而言:尼龍膜較強(qiáng);硝酸纖維素膜較脆,易破碎;PVDF膜較強(qiáng)。
就重復(fù)性而言:尼龍膜可反復(fù)用于分子雜交,雜交后,探針分子可經(jīng)堿變性被洗脫下來;硝酸纖維素膜(NC膜)不能重復(fù)使用;PVDF膜可以重復(fù)使用。
Western blot時該選擇NC膜還是PVDF膜?
硝酸纖維素膜:硝酸纖維素膜(NC膜)是蛋白印跡實(shí)驗(yàn)的標(biāo)準(zhǔn)固相支持物。在低離子轉(zhuǎn)移緩沖 液的環(huán)境下,大多數(shù)帶負(fù)電荷的蛋白質(zhì)會與硝酸纖維素膜發(fā)生疏水作用而高親和力的結(jié)合在一起,雖然這其中的機(jī)制還不是十分清楚,但由于硝酸纖維素膜(NC膜)的這個特性,而且易于封閉非特異性結(jié)合,從而得到了廣泛的應(yīng)用。在非離子型的去污劑作用下,結(jié)合的蛋白還可以被洗脫下來。根據(jù)被轉(zhuǎn)移的蛋白分子量大小,要選擇不同 孔徑的硝酸纖維素膜(NC膜)。因?yàn)殡S著膜孔徑的不斷減小,膜對低分子量蛋白的結(jié)合就越牢固。但是膜孔徑如果小于0.1mm,蛋白的轉(zhuǎn)移就很難進(jìn)行了。因此,我們通 常用0.45μm和0.2μm兩種規(guī)格的硝酸纖維素膜。大于20kD的蛋白就可以用0.45μm的膜,小于20kD的蛋白就要用0.2μm的膜了,如果用 0.45μm的膜就會發(fā)生“Blowthrough”的現(xiàn)象。從膜的質(zhì)地上來看,zui重要的指標(biāo)就是單位面積上能夠結(jié)合的蛋白的量。硝酸纖維素膜(NC膜)的結(jié)合能力主要與膜的硝酸纖維素的純度有關(guān),市場上有些硝酸纖維素膜(NC膜)通常會還有大量的醋酸纖維素,因而降低了蛋白的結(jié)合量。如果采用的是100%純度的硝酸纖維素, 保證了zui大的蛋白結(jié)合量,可達(dá)80-150μg/cm2。由于100%的純度,因而也大大減少了非特異性的結(jié)合,降低雜交背景,無 需高嚴(yán)謹(jǐn)度的洗脫步驟。其次,膜的強(qiáng)度和韌性也是需要考慮的因素。常規(guī)的硝酸纖維素膜比較脆,漂洗一兩次就會破損,不能反復(fù)使用。
PVDF轉(zhuǎn)移膜:PVDF是一種高強(qiáng)度、耐腐蝕的物質(zhì),通常是用來制造水管的。 PVDF膜可以結(jié)合蛋白質(zhì),而且可以分離小片段的蛋白質(zhì),zui初是將它用于蛋白質(zhì)的序列測定,因?yàn)橄跛崂w維素膜在Edman試劑中會降解,所以就尋找了 PDVF作為替代品,雖然PDVF膜結(jié)合蛋白的效率沒有硝酸纖維素膜高,但由于它的穩(wěn)定、耐腐蝕使它成為蛋白測序理想的用品,一直沿用至今。PVDF膜與 硝酸纖維素膜一樣,可以進(jìn)行各種染色和化學(xué)發(fā)光檢測,也有很廣的適用范圍。這種PVDF膜,靈敏度、分辨率和蛋白親和力在精細(xì)工藝下比常規(guī)的膜都要高,非 常適合于低分子量蛋白的檢測。但PVDF膜在使用之前必需用純甲醇進(jìn)行浸泡飽和1-5秒鐘。
使用PVDF膜時,一定要先用無水甲醇預(yù)處理,再在transfer buffer中平衡好才可以使 用(PVDF膜用甲醇泡的目的是為了活化PVDF膜上面的正電基團(tuán),使它更容易跟帶負(fù)電的蛋白質(zhì)結(jié)合)。經(jīng)過預(yù)處理的PVDF膜在轉(zhuǎn)膜時, 可以使用不含甲醇的transfer buffer。而使用NC膜時,有的需要用無水甲醇處理,有的則不必,直接用transfer buffer平衡好就可以了。
小結(jié):綜上所述,可以根據(jù)NC膜和PVDF膜的特點(diǎn),以及實(shí)驗(yàn)的目的去選擇雜交膜,例如使用PVDF膜之前一定要經(jīng)過甲醇處理,當(dāng)抗原抗體識別識別需要維持其三級結(jié)構(gòu)時,則選擇NC膜。
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