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CAT#:D1600-50
細(xì) 菌 DNAOUT /Bacterial DNAOUT使用說明書
產(chǎn)品及特點(diǎn) :本產(chǎn)品可以用于絕大多數(shù)革氏陽性和陰性細(xì)菌基因組 DNA 的快速提取。
1. DNA 純凈,OD260/280 一般都在 1.9 左右,可直接用于 PCR、酶切、雜交等實(shí)驗(yàn)。
2. DNA 產(chǎn)量一般在 5-20 ug/mL 飽和菌液(108-109個(gè)細(xì)胞)。
3. 操作簡單,整個(gè)過程約 15 分鐘,容易放量操作。
4. 每次提取可以處理 0.1-1.5 mL 的細(xì)菌,也可以使用菌落。
5. 安全無毒,本試劑盒對人體無害,無腐蝕性和刺激性氣味。
規(guī)格及成分: 成 份 編 號 50次包裝 250次包裝
* 100406 600 mg 3 g
溶液 A D1600-50A 30 mL 150 mL
溶液 B D1600-50B 7.5 mL 40 mL
RNase A 溶液(10mg/mL) 3160 0.75 mL 4 mL
運(yùn)輸及保存:常溫運(yùn)輸及保存(*需要-20℃保存)有效期一年。
自備試劑: 超純水、氯仿和 TE 緩沖液。
使用方法: 注意:溶液 A 和溶液 B 容易產(chǎn)生沉淀,溶液 B 比較粘稠,用前均需要放置在 65℃預(yù)熱使沉淀溶解、粘稠度降低,用前充分搖勻。
一: 對革氏陰性細(xì)菌樣品
1. 將 0.1-1.5 mL 過夜培養(yǎng)的菌液轉(zhuǎn)移到 1.5 mL 塑料離心管中, 12000-15000 g室溫離心 1 分鐘沉淀細(xì)菌,棄上清。
2. 加入 600 uL 預(yù)熱的溶液 A 到細(xì)菌沉淀中,充分吹打均勻。
3. 再加入 150 uL 預(yù)熱的溶液 B 到離心管中,顛倒數(shù)次混勻。此時(shí)溶液中可能有白色絲狀懸浮物產(chǎn)生。由于溶液 B 比較粘稠,可以采取稱量方法取用,150 uL 約等于 150-160 mg。也可以將 1 mL 槍頭剪去一截再吸取。也可以同時(shí)加入 15 uL的 RNase A 溶液。
4. 65℃放置 3-5 分鐘。如果室溫放置,DNA 產(chǎn)量會(huì)降低 10-20%。
5. 加入 200 uL 自備氯仿,震蕩混勻 10-30 秒,此時(shí)溶液將呈乳白色。
6. 12000-15000 g 室溫離心 2 分鐘。此時(shí)上清液將變得透明,中間層有白膜。小心轉(zhuǎn)移上清液到一個(gè)新的 1.5 mL 塑料離心管中,避免觸及中間層的白膜。
7. 加入 1 倍體積(約 750 uL)的異丙醇到上清液中,用手上下顛倒 30 秒混勻。此時(shí)一般將有絮狀 DNA 沉淀出現(xiàn)。
8. 12000-15000 g 室溫離心 3 分鐘。此時(shí)管底將有微小 DNA 沉淀,小心棄上清,注意不要丟棄 DNA 沉淀。
9. 在離心管中加 1 mL 75%乙醇,短暫震蕩,12000-15000 g 室溫離心 3 分鐘,棄上清。
10. 重復(fù)上述操作一次。
11. 短暫離心,小心吸棄殘留的液體(約 50 µL)。此步不要省略,否則殘留的液體(含
乙醇)將會(huì)影響 DNA 電泳、酶切很 PCR 等反應(yīng)。
12. 立即加入 50-100 µL TE 緩沖液充分溶解 DNA 沉淀。注意:由于基因組 DNA 較長并在沉淀時(shí)形成緊密復(fù)合物,充分溶解的時(shí)間遠(yuǎn)長于質(zhì)粒 DNA 或 PCR 片段,有時(shí)需要長達(dá)數(shù)小時(shí)。如果在第 3 步?jīng)]有加 RNase A 溶液,或雖然加了但還擔(dān)心有殘留的 RNA 污染,可以在此時(shí)補(bǔ)加 5-10 uL 的 RNase A 溶液,保溫 30 分鐘。
13. 直接取 5-10 uL 電泳檢測 DNA,其余放冰箱備用。
二: 對革氏陽性細(xì)菌樣品
1. 將 0.1-1.5 mL 過夜培養(yǎng)的革氏陽性細(xì)菌 12000-15000 g 室溫離心 1 分鐘后, 重懸于 0.6 mL 溶菌液中(溶菌液配制:30 mL 超純水+600 mg *,配制后分裝成小管并放-20℃長期保存,每次只用一小管),顛倒混勻 5-10 次后放 37℃保溫至少 30 分鐘(有的革氏陽性菌種可能需更長時(shí)間,需要自己根據(jù)不同的細(xì)菌摸索)。
2. 12000-15000 g 室溫離心 10 分鐘,小心棄上清。
3. 后續(xù)處理接上面的革氏陰性細(xì)菌提取步驟中的第 2 步。
三: 其他注意事項(xiàng)
1. 可以直接使用細(xì)菌菌落提取 DNA,操作時(shí)直接將細(xì)菌菌落挑入到溶液 A 中,后續(xù)操作同上。
2. 從單個(gè)菌落中提取到的 DNA 較少,所以只用 10-30 uL TE 溶解。
背景資料
G+和 G-細(xì)菌細(xì)胞壁比較
細(xì)胞壁特性 革氏陰性菌 革氏陽性菌
厚度 10 nm 20-80 nm
細(xì)胞膜層數(shù) 2 1
肽聚糖(Peptidoglycan)含量 10-20% >50%
磷壁酸(Teichoic acid) 無 有
脂及脂蛋白含量 58% 0-3%
蛋白含量 9% 0%
脂多糖(Lipopolysaccharide)含量 13% 0
對*敏感性 低 高
對*(Lysozyme)敏感性 低 高
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