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揭示DNA密碼中的5-羥甲基胞嘧啶隱秘信息

閱讀：852發(fā)布時間：2012-5-29

      由于缺少在全基因組范圍內，對5-羥甲基胞嘧啶（5hmC）進行單個堿基水平分辨率的作圖手段，對5hmC的研究一直進展緩慢。傳統(tǒng)的親和純化手段不能準確定位5hmC，也不能確定它在每一修飾位點的相對豐度。Chuan He等人運用Tet輔助的重亞硫酸鹽測序（TAB-Seq）技術，與傳統(tǒng)的重亞硫酸鹽測序技術結合,在基因組范圍內以單個堿基的分辨率對5hmC進行作圖，并確定5hmC與5mC的相對豐度。

將這一技術應用于胚胎干細胞，他們不僅證實了5hmC在哺乳動物基因組中廣泛分布，而且顯示5hmC位點更易于出現(xiàn)在某些特殊序列當中，并具有在兩條DNA鏈分布的不對稱性。他們還發(fā)現(xiàn)鄰近轉錄因子結合的DNA位點存在高水平的5hmC和低水平的5mC。此外，5hmC分布水平在不同功能序列元件之間差異也很大。這提示5hmC的修飾和保持在這些元件之間的機制是不同的。


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