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實驗室設計時應至少將微生物實驗室劃分成3個區(qū)域：

包括辦公室、休息室、培養(yǎng)基配制室與試劑儲藏室。此區(qū)域禁止帶人細菌檢驗標本。

(1)污染物處理：操作區(qū)須備有消毒缸，以處理沾有活菌的玻片等污染物品。

(2)水源：操作區(qū)內須設置水源。

(3)溫度和濕度：配置空調進行控制。

(4)電源：要求提供穩(wěn)壓、恒頻的電源;配備不間斷電源。

(5)通風：由于各種病原菌集中，空氣污濁，實驗要求在保持排風的生物安全柜中進行。

(6)光線：細菌培養(yǎng)的細小菌落及血清試驗凝集顆粒的觀察， 都需要有充足的光線。操作區(qū)除設置常規(guī)照明燈外，還必須安裝操作臺燈，以保證實驗結果的正確判斷。

(7)整潔：微生物操作區(qū)是各種病原菌相對集中的地方，為了減少粉塵流動，防止交叉污染，操作區(qū)應與外界分開。

(1)無菌室內應有空氣過濾凈化裝置，并安裝空調。

(2)無菌室僅用于培養(yǎng)基分裝等無菌操作，不能進行有菌標本的操作。操作人員操作時應嚴格關門，并戴好專用的口罩、帽子。

(3)無菌室必須保持整潔。無菌室使用前須用紫外線消毒，操作結束后清潔臺面，再用紫外線消毒。定期用乳酸或甲醛熏蒸，消毒。

(4)無菌室應封閉，進出無菌室至少要經兩道門，中間隔有緩沖間，無菌室與外間設置一個可開閉的窗口，用于傳遞器具。