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PPR 蛋白的 RNA 結(jié)合模式與已知的 RNA 結(jié)合蛋白均不同。 PPR 蛋白由多個 PPR 重復單元組成,大多數(shù)情況下,一個經(jīng)典的 PPR 重復單元含有35個氨基酸,每一個重復單元可以特異性地識別一個 RNA 堿基,近兩年的生物信息學和初步生物化學研究研究顯示 PPR 模塊與 RNA 序列有特異的對應(yīng)關(guān)系,但其識別機理及識別密碼尚不明確。揭示 PPR 蛋白特異識別 RNA 堿基的分子機制對于理解 PPR 蛋白的工作機理以及促進 PPR 蛋白生物技術(shù)領(lǐng)域的應(yīng)用具有重要意義。{試劑酶聯(lián)網(wǎng):www.shjgogo.com} ELISA試劑盒相關(guān)產(chǎn)品推薦:
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顏寧教授研究組與施一公、朱健康、王佳偉、王宏偉等課題組合作,選擇源自玉米葉綠體的 PPR10 蛋白進行了深入的結(jié)構(gòu)生物學和生物化學分析,zui終獲得了 PPR10 蛋白在未結(jié)合 RNA 和特異結(jié)合靶標PSAJ單鏈 RNA 兩種狀態(tài)下的高分辨率晶體結(jié)構(gòu)。結(jié)構(gòu)顯示, PPR10 包含19個 PPR 重復單元,每個 PPR 重復單元均為helix-loop-helix結(jié)構(gòu),多個重復單元組成兩圈右手超螺旋。 PPR10 -PSAJ的復合體晶體結(jié)構(gòu)則清晰地揭示了 PPR 蛋白特異性識別 RNA 堿基的分子機理。特異識別發(fā)生于 PPR 重復單元的第2、5、35位的氨基酸與相對應(yīng)的 RNA 堿基,這一結(jié)構(gòu)生物學發(fā)現(xiàn)為破解 PPR 的 RNA 識別密碼提供了直接的依據(jù)。
自然界中有許多具有重復單元構(gòu)造的蛋白質(zhì),其結(jié)構(gòu)與功能的揭示往往可以把這些蛋白質(zhì)改造為重要的工具蛋白。例如科學家根據(jù) TALE 蛋白對 DNA 序列的特異識別,設(shè)計組裝能夠識別任意序列雙鏈 DNA 的 TALE N工具酶,進而對基因組進行改造。 TALE N已經(jīng)在多個物種中獲得了廣泛應(yīng)用。這是顏寧課題組與合作者繼 2012 年 1 月在《科學》報道 TALE 蛋白識別雙鏈 DNA 的分子機制后,對重復單元蛋白的又一項結(jié)構(gòu)與功能研究,希望可以促進 PPR 在生物技術(shù)中的應(yīng)用。
上海同步輻射光源(SSRF)何建華研究員及郁峰博士為數(shù)據(jù)收集提供了及時有效的幫助,保證了研究組在這一課題上取得突破。南開大學龍加福研究組為 PPR 蛋白的生化性質(zhì)鑒定提供了重要支持。
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